ゴジラとキングコングが対決する「モンスターバース」シリーズの最新作。
地球はモンスターの破壊により荒廃していた。
人類はモナークという組織を通じて、巨大怪獣の起源を探る。
しかし、ゴジラが突然暴れ出し、世界に危機が迫る。
人類は最後の希望として、コングを髑髏島から呼び出す。
ゴジラとコングの壮絶な戦いが始まる。